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Psymberin

Eigenschaften, Daten und Datenquellen.



Psymberin - auch bekannt als Irciniastatin A - ist eine organisch-chemische Verbindung, die als Naturstoff unter anderem in bestimmten Meeresschwämmen (Psammocinia, Ircinia ramosa) aufgefunden und daraus isoliert wurde.

Die Substanz erwies sich schon in nanomolaren Konzentrationen als starker Wachstumsinhibitor für gewisse Krebszellen.

 

Bezeichnungen und Identifikatoren

Bezeichnung
Psymberin
Formel
C31H47NO11
Molekulargewicht, Molekülmasse
609,713 (g/mol)
CAS-Nummer
714954-37-7
InChI Key
BNNIEBYABSNREN-CYRUSRGFSA-N

Systematischer Name
(1R,6S)-1,5-Anhydro-2,4-didesoxy-1-{(2S,3R)-3-[(3R)-6,8-dihydroxy-5-methyl-1-oxo-3,4-dihydro-1H-isochromen-3-yl]-2-hydroxybutyl}-6-C-{[(2S,3S)-2-hydroxy-3-methoxy-5-methyl-5-hexenoyl]amino}-2,2-dimeth yl-6-O-methyl-D-erythro-hexitol

Weitere Bezeichnungen, Synonyme
Iriciniastatin A

Englische Bezeichnung
Psymberin
(+)-Iriciniastatin A

 

Chemische Formeln

Brutto- bzw. Summenformel und Strukturformel der chemischen Verbindung Psymberin:

 

Psymberin

 

C31H47NO11

Mr = 609,713 g/mol

(1R,6S)-1,5-Anhydro-2,4-didesoxy-1-{(2S,3R)-3-[(3R)-6,8-dihydroxy-5-methyl-1-oxo-3,4-dihydro-1H-isochromen-3-yl]-2-hydroxybutyl}-6-C-{[(2S,3S)-2-hydroxy-3-methoxy-5-methyl-5-hexenoyl]amino}-2,2-dimeth yl-6-O-methyl-D-erythro-hexitol
SMILES: O=C2O[C@H](Cc1c(c(O)cc(O)c12)C)[C@H](C)[C@@H](O)C[C@H]3O[C@H]([C@H](OC)NC(=O)[C@@H](O)[C@@H](OC)CC(=C)C)C[C@@H](O)C3(C)C

 

Daten und Eigenschaften

Übersicht über die (bekannten) chemischen und physikalischen Eigenschaften: Psymberin. Es gelten - soweit nicht anders angegeben - Raumumgebungsbedingungen (Normaldruck, 0 % Luftfeuchtigkeit, 20 °C).

Dichte

 

Spektroskopische Daten:

MoNA Mass Bank of North America (Massenspektren)
BNNIEBYABSNREN-CYRUSRGFSA-N

Berechnetes NMR-Spektrum (Predict Spectra via NMRDB)
1H NMR Spektrum, 13C NMR Spektrum.

 

Prozentuale und isotopische Zusammensetzung:

Massenbezogene elementare Zusammensetzung und Isotopen-Anteile der Verbindung Psymberin - C31H47NO11 - berechnet auf Grundlage der Molekülmasse.

.

Symbol
Element E
Anzahl x
der Atome Ex
Daten des Elements
und der Isotope *
Prozentanteile
der Isotope
Prozent-Anteil von
Ex an Formelmasse
C
Kohlenstoff
31 Ar = 12,011 u
ΣAr = 372,341 u
12C: 12 u [98,94 %]
13C: 13,00335 u [1,06 %]
14C: 14,00324 u [<< 1 %]
 
12C: 60,42092 %
13C: 0,64732 %
14C: Spuren
61,0682 %H
Wasserstoff
47 Ar = 1,008 u
ΣAr = 47,376 u
2H: 2,0141 u [0,01 %]
3H: 3,01605 u [<< 1 %]
1H: 1,00783 u [99,99 %]
 
2H: 0,00078 %
3H: Spuren
1H: 7,76944 %
7,7702 %N
Stickstoff
1ΣAr = 14,007 u
14N: 14,00307 u [99,6205 %]
15N: 15,00011 u [0,3795 %]
 
14N: 2,28859 %
15N: 0,00872 %
2,2973 %O
Sauerstoff
11 Ar = 15,999 u
ΣAr = 175,989 u
16O: 15,99491 u [99,757 %]
17O: 16,99913 u [0,03835 %]
18O: 17,99916 u [0,205 %]
 
16O: 28,7941 %
17O: 0,01107 %
18O: 0,05917 %
28,8642 %

*) Die dritte Spalte führt die Atommassen bzw. Isotopenmassen der beteligten Elemente sowie - in eckigen Klammern - die natürliche Isotopenzusammensetzung auf.

 

Weitere berechnete Daten

Die molare Masse ist M = 609,713 Gramm pro Mol.

Die Stoffmenge von einem Kilogramm der Substanz ist n = 1,64 mol.

Die Stoffmenge von einem Gramm der Substanz ist n = 0,002 mol.

Monoisotopische Masse: 609,3149113374 Da - bezogen auf 12C311H4714N16O11.

 

Externe Informationsquellen

PubChem:ID 11692946ChemSpider:ID 9867673ECHA Info Card:

 

Hersteller und Bezugsquellen

In der nachfolgenden Tabelle sind Produzenten und Lieferanten von Psymberin als kommerzielle Chemikalie für Labor, Forschung, Industrie und Produktion mit den entsprechenden Kontaktdaten verzeichnet.

 

Literatur und Quellen

[0] - Fach- und Forschungsartikel in wissenschaftlichen Zeitschriften via PubMed: Psymberin.

[1] - Robert H. Cichewicz, Frederick A. Valeriote, Phillip Crews:
Psymberin, A Potent Sponge-Derived Cytotoxin from Psammocinia Distantly Related to the Pederin Family.
In: Organic Letters, (2004), DOI 10.1021/ol049503q.

[2] - George R. Pettit et al.:
Isolation and Structure of Irciniastatins A and B from the Indo-Pacific Marine Sponge Ircinia ramosa.
In: Journal of Medicinal Chemistry, (2004), DOI 10.1021/jm030207d.

[3] - Xianhai Huang et al.:
The Total Synthesis of Psymberin.
In: Organic Letters, (2007), DOI 10.1021/ol071068n.

[4] - Jie Yu, Mingze Yang, Yian Guo, Tao Ye:
Total Synthesis of Psymberin (Irciniastatin A).
In: Organic Letters, (2019), DOI 10.1021/acs.orglett.9b01113.

 


Letzte Änderung am 27.02.2024.


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